稻妻城地下核心入口位于稻妻城主城北侧桥下的隐蔽洞穴，另一处关键入口在鸣神大社地下，需完成神樱大祓任务解锁。
先讲主城地下入口：传送到稻妻城中心传送锚点，直行向北走到大桥中央，面朝北偏西方向低空飞行，可见桥下河岸处有被藤蔓半掩的黑黝黝洞口，直接下落即可进入。入口坐标大致在主城建筑正下方偏西北，内部是连贯的地下河道与石室，可一直通到鸣神大社地下区域边缘。该入口无需前置任务，任何阶段都能进入，适合快速探索与收集。
鸣神大社地下是稻妻城最大、奖励最密集的地下区域，入口在鸣神大社主殿后方悬崖底部，初始被雷印屏障封锁。解锁必须完成世界任务神樱大祓，跟随NPC花散里逐步净化三处神樱树根，最终解除主殿地下封印，开启大型洞窟。洞内结构复杂，分多层平台与水系通道，散落大量精致宝箱、珍贵宝箱及两个雷神瞳，是资源收集核心区域。
探索稻妻城地下需注意环境与配队。主城地下多水洼与狭窄通道，建议带冰元素角色方便涉水，或用岩元素角色铺路防卡视角；鸣神大社地下有少量雷元素怪物与机关，配队优先雷元素破盾、冰元素控场，搭配治疗角色保障续航。洞内部分区域光线昏暗，可开启元素视野标记隐藏宝箱与路径，避免迷路。
地下区域除常规宝箱外，还有隐藏彩蛋与探索要点。主城地下河道尽头能透过岩层看到主城街道底部，可观察地面NPC行动；鸣神大社地下深处有废弃祭坛，角落藏有世界任务相关线索，完成探索可解锁额外成就。另外，两处地下区域连通，从主城入口可一路走到鸣神大社地下，无需重复传送，高效完成全收集。
