元气骑士中可融合的武器覆盖近战、远程、弓弩、法杖、手枪、冲锋枪等多个品类，主流融合组合包含光剑系列、雪狐系列、鹰类手枪、元素近战武器、弓弩组合以及各类枪械与特殊道具搭配，不同组合能融合出强度、特效截然不同的全新武器。
近战武器是融合玩法里最常用的类别，光剑红、光剑绿、光剑蓝三把武器可以融合成光剑土豪金，也是近战综合实力顶尖的装备。火焰剑与冰霜剑相互融合能够得到雷剑，攻击附带闪电范围伤害；破碎的剑柄搭配破碎的剑刃，可融合为重铸的圣剑，具备稳定输出与特殊打击效果。雷电战锤与电弧手里剑融合为宙斯之矛，攻击范围大幅提升，适合应对成群小怪。融合操作需要在地牢场景内完成，手持一把材料武器，将另一把放置在地面，出现漩涡图标后点击即可融合，三把武器融合则需要手持两把、地面摆放一把。
远程枪械与手枪的融合体系十分庞大，雪狐系列遵循递进融合规则，两把雪狐融合为大雪狐，两把大雪狐融合为巨雪狐，以此类推还能合成更高阶形态，雪狐土豪金搭配樱花霰弹枪可融合成雪狐玫瑰金。鹰类手枪玩法灵活，冰霜之鹰与火焰之鹰融合为冰火鹰，两种不同类型鹰类手枪加上樱花霰弹枪，能够融合出嘤嘤鹰。四把破旧的手枪可以融合成妙妙枪，熔炉与冰川融合为极光，突击步枪、冲锋枪也可两两融合进阶，逐步提升伤害与射速。
弓弩、法杖及特殊道具的融合同样有很高实战价值，火焰弓、冰霜弓、珺之弓三把武器融合为群星之弓，箭矢自带追踪效果，清怪能力极强。英雄弓与风之弓可融合成魔法弓，强弓两两融合能得到弓plus，弩类武器也可两两融合进阶。法杖方面，浪潮法杖搭配干草叉融合为三叉戟，大葱与浪潮法杖融合为有机后浪，网瘾少年与网瘾少女融合为羊叫兽，各类趣味组合都能在地牢战斗中发挥独特作用。玩家融合前建议卸掉武器配件，避免配件被消耗，同时可以借助角色技能、天赋强化融合武器的实战能力。
