口袋妖怪火红中再次到达三岛，核心是持有三岛通行证，前往枯叶市港口与水手对话，直接选择三岛即可乘船抵达，无需重复前期剧情。
首次前往三岛需先打完红莲岛第七道馆，触发正辉剧情，随其前往一岛，从锦辉处拿到三岛通行证，完成二岛找小女孩的前置任务后解锁三岛航线。完成三岛主线（救小女孩、打暴走族）返回关都后，通行证不会失效，这是反复往返的关键。后续想再去，不用找正辉或触发剧情，直接去枯叶市港口即可。
抵达枯叶市港口后，找到停靠在码头的渡轮，与船头水手对话，弹出航线选择界面，选中“三之岛”即可出发。航行过程无额外战斗或解谜，稍作等待就能靠岸。三岛码头和城镇布局与首次一致，可直接探索绊桥、树果森林等区域，无需再次清理暴走族，此前完成的剧情进度会保留。
再次前往三岛有不少实用玩法。树果森林会定期刷新各类树果，适合收集恢复类道具；绊桥沿途有多位训练家，可反复对战刷经验与金币；森林深处还能遇到稀有野生宝可梦，方便补充队伍阵容。另外，三岛南侧洞穴可拾取金块，能售卖换取大量金币，为培养宝可梦提供资源。
需要注意，若未完成二岛前置任务，首次去三岛会被暴走族阻挡，无法深入；但再次前往无此限制，可自由探索全岛。同时，确保队伍携带冲浪、碎岩等秘传技能，方便在岛屿周边水路和洞穴中探索隐藏区域，获取更多稀有道具与宝可梦。
